Kompleks Masjid Shepherd Mustafa Pasha terletak di sebuah bukit di bagian barat laut Gebze di Provinsi Kocaeli. Bangunan kompleks yang dikelilingi jalan di empat sisinya menempati situs berbentuk persegi panjang. Menurut prasasti di gerbang masjid, pembangunannya kompleks ini ditugaskan pada tahun 1523 oleh penggembala Mustafa Pasha, yang meninggalkan hidupnya sebagai penggembala untuk bergabung dengan ekspedisi Selim I ke Mesir, akhirnya menjadi penguasa Mesir, wazir, dan menantu Sultan. Bangunan kompleksnya sejajar dengan kiblat, dan masjid terletak di tengah, didahului dengan halaman berbentuk persegi panjang dengan pancuran wudhu besar di tengahnya, dan di sebelah selatannya terdapat taman besar bertembok yang mengelilingi makam sang pendiri.