Masjid Isa Bey adalah salah satu contoh arsitektur Seljuk yang paling akurat. Terletak di Efesus di bawah Katedral St. John. Dibangun oleh arsitek Suriah Ali bin Mishimish al-Dimashqi antara tahun 1374 dan 1375 M. Masjid ini dirancang asimetris, berbeda dengan gaya tradisional. Letak jendela, pintu, dan kubah sengaja tidak serasi, serta terdapat prasasti Islam yang menghiasi pintu masuknya. Tiang-tiang di dalam musala berasal dari reruntuhan masa lalu di Efesus, sehingga membentuk kesan yang menarik. Berbeda dengan masjid, kubahnya dihiasi pola biru kehijauan yang menampakkan ciri khas gaya Ottoman.