फोर्ट जीसस संग्रहालय इसी नाम के सैन्य किले में स्थित है, जिसे सोलहवीं शताब्दी ईस्वी में पुर्तगालियों द्वारा बनाया गया था। इसे मोम्बासा में सबसे अच्छे पर्यटन क्षेत्रों में से एक माना जाता है, और यह यूनेस्को की विश्व धरोहर स्थल है। यह संग्रहालय खोजों, पुरातात्विक अवशेषों, ओमानी आभूषणों और कुछ प्रदर्शनियों का संग्रह प्रदर्शित करता है जो स्वाहिली जीवन और अन्य के बारे में बहुत कुछ बताते हैं।