नीली गुफाओं का नाम उनके साफ नीले रंग के कारण पड़ा है जो आसपास के पानी पर हावी होता है और उनकी सुंदरता को बढ़ाता है, खासकर जब सूर्य की किरणें उजागर क्षेत्रों पर प्रतिबिंबित होती हैं। इस क्षेत्र में गुफाओं का आकार इस हद तक भिन्न है कि उनमें से कुछ पर्यटक नौकाओं के गुजरने के लिए काफी बड़ी हैं, जबकि नावें दूसरों के पास रुकती हैं और पर्यटक इन गुफाओं के रहस्यों का पता लगाने के लिए तैरकर रास्ता जारी रखते हैं।