مسجد الحكيم هو ثاني أكبر مسجد فاطمي في مصر وقد صٌمم على غرار مسجد أحمد بن طولون، وتم بناء المسجد بشكل أساسي من الطوب، باستثناء المئذنتين الفريدتين، فقد تم إنشاؤهما من أحجار مستوردة. ويتكون المسجد من صحن مكشوف به أربع قاعات "رواق" تحيط به من الاتجاهات الأربعة وأكبرها وأجملها رواق القبلة الذي يحدد اتجاه مكة حيث يجب أن يتجه المسلمون أثناء الصلاة. ويٌعد هذا المسجد من أفضل الأمثلة على العمارة الإسلامية في البلاد.