تشير التقديرات إلى أن مدرسة افغونلو قد تم بناؤها في القرن الثالث عشر، وهي عبارة عن مبنى مستطيل يقع في وسط مدينة قيصري ويتم الدخول إليه عبر الباب المواجه للغرب، ويوجد في وسطها فناء كبير توجد على جوانبه غرف مدرسية ذات أروقة على أعمدة مربعة، وهناك أربع غرف متقابلة في الاتجاهين الشمالي والجنوبي، وقد بدأت مدرسة افغونلو العمل كمكتبة بعد ترميمها.