Kadak Ahmed Paşa Camii'nin güneydoğusunda hamam ve caminin üstündeki terasta mimar Ayad Ağa tarafından büyük bir külliyenin parçası olarak inşa edilen taş okul binası dikdörtgen planlı olup üzeri iki sıra kesme taşla örtülmüştür. Büyük kubbeli ve 24 küçük kubbeli, ortasında bir avlu bulunan Osmanlı Medresesi tipik bir örnektir.Osmanlı Medresesi, her biri avlunun iki yanında balkonlara açılan 7 odalı özel bir dershaneden oluşur. 20. yüzyılın başlarına kadar okul olarak kullanılmış, onarılarak tarihi müzeye dönüştürülmüştür.