Çoban Mustafa Paşa Camii Külliyesi, Kocaeli İli, Gebze ilçesinin kuzeybatı kesiminde bir tepe üzerinde yer almaktadır.Dört tarafı yollarla çevrili olan külliyenin binaları dikdörtgen bir alan kaplamaktadır.Caminin kapısındaki kitabesine göre inşaatı Külliyenin külliyesi, Yavuz Selim'in Mısır seferine katılmak üzere çobanlık hayatını bırakan ve sonunda Mısır'ın hükümdarı, veziri ve padişahın damadı olan çoban Mustafa Paşa tarafından 1523 yılında yaptırılmıştır. Külliyenin binaları kıble hizasında olup, ortada cami, önünde büyük bir şadırvan bulunan dikdörtgen bir avlu, güneyinde ise kurucusunun mezarını çevreleyen geniş duvarlı bir bahçe bulunmaktadır.