Modern Paleopoli Müzesi binası, müzenin bunları sergileme ve koruma konusunda uzmanlaştığı ada bölgesindeki kazı ve antika alanlarından gelen farklı bir eser koleksiyonunu içermektedir. Müzenin en önemli koleksiyonları arasında tarih öncesi çağlardan kalma eserler, mermer ve bronz heykeller, tarihi çağlardan cenaze törenleri, metal parçalar, çömlekler ve altın takıların yanı sıra antik tapınak yapılarının parçaları ve parçaları yer alıyor.