Bu müze, Roma'ya klasik sonrası döneme ait bir arkeoloji müzesi kazandırmak ve antik dünyanın dönüşümünü incelemek için stratejik bir dönemde araştırmaları teşvik etmek amacıyla MS 1967 yılında Avrupa'daki Palazzo delle Senzi'de açıldı. Orta Çağ Ulusal Müzesi'nde, çoğunluğu Roma ve orta İtalya'dan olmak üzere, MS 14. yüzyıla kadar uzanan eşyalar sergilenmektedir. Bu müzede sergilenen koleksiyonlar arasında, Mısır'ın eski ve erken Orta Çağ'daki (MS 5. ila 10. yüzyıllar) sanatsal üretiminin önemli bir örneğini sunan yazıt ve kumaşlardan oluşan “Kıpti” koleksiyonu da yer alıyor.