Kubat Paşa Mektebi, Türkiye tarihinde Osmanlı dönemi boyunca Tarsus şehrinin kültürel, sosyal ve dini hayatında önemli bir rol oynamış, İslam dini ilimler konusunda şehrin en önemli eğitim yapısını oluşturmuş ve eğitim-öğretimde yardımcı olmuştur. Bunu, dünyanın dört bir yanından gelen ziyaretçilere açık bir müze haline gelmeden önce, Tarsus Antik Kenti'nin tam ortasındaki seçkin konumu, turistler ve yerli halktan kaynaklanmaktadır.