Midilli Arkeoloji Müzesi koleksiyonu, Yunanistan'ı, onun antik uygarlığını ve binlerce yıl öncesine dayanan antik eserlerini öğrenmek isteyen ziyaretçilere açık iki binada dağıtılmaktadır. Eski müze binası, mezar taşları, mermer heykeller, heykeller, madeni paralar, mücevherler ve günlük yaşamda kullanılan aletler dahil olmak üzere Roma uygarlığına ve onun öncüllerine ait arkeolojik koleksiyonlardan oluşan bir koleksiyon içermektedir. İkinci bina ise arkeologların devam eden kazılar sırasında tanrı Afrodit'e ait tapınak kalıntılarından bulduklarını sergilemek ve turistlerin mozaik zeminleri ve heykelleri görebilmesi konusunda uzmanlaşmıştır.