تقع كنيسة سانتوس خوانيس بجانب متحف الباسك، وهي نموذج للكنيسة اليسوعيّة، وتعود إلى القرن السابع عشر، وتتميّز بطابع باروكي وفي نفس الوقت تمتلك بعض من عناصر عصر النهضة، وبها مذبح مخصّص للقلب المقدّس الفريد من نوعه في العالم، ويقصدها الزوّار باستمرار لمشاهدة واستكشاف هذا المعلم الأثري والديني العريق والمميّز المليء بالنقوش والزخرفات.