Zakynthos kehilangan banyak gereja dan bangunannya karena gempa bumi kuat yang melanda pulau itu pada tahun 1953, menyebabkan beberapa gereja terpentingnya hancur, sehingga menimbulkan kebutuhan untuk memindahkan harta milik gereja, termasuk lukisan artistik religius yang menggambarkan kehidupan orang-orang kudus Kristen. , ikon gereja yang berharga, mural artistik, dan properti gereja lainnya, hingga gedung baru untuk melestarikannya.Dengan demikian, Museum Zakynthos didirikan, dan dari sinilah pentingnya museum tersebut.