Gereja Santo Fransiskus adalah salah satu gereja Eropa tertua di India yang dibangun pada tahun 1503. Gereja ini memiliki sejarah yang sangat penting karena merupakan saksi bisu konflik kolonial Eropa di anak benua India. Pasalnya penjelajah Portugis Vasco da Gama yang menemukan jalur laut dari Eropa ke India meninggal di Kochi dan dimakamkan di gereja selama 14 tahun sebelum jenazahnya diangkut ke Lisbon.