Kebun Binatang San Diego, kebun binatang unik yang terletak di dalam Taman Balboa, adalah suaka margasatwa nirlaba dan rumah bagi lebih dari 3.500 hewan langka. Kebun binatang ini didirikan pada tanggal 2 Oktober 1916, menjadi salah satu kebun binatang paling terkenal di dunia. Selain hewan, taman ini memiliki koleksi tumbuhan terkemuka yang terdiri dari lebih dari 700.000 spesies tumbuhan, selain Institut Penelitian Kebun Binatang San Diego dan Taman Safari San Diego. Di antara hewan-hewan yang akan Anda lihat adalah sekelompok burung seperti flamingo, selain kucing besar seperti singa, harimau, dan cheetah, serta beruang seperti panda dan beruang kutub, reptil, dan masih banyak lainnya.