Restoran Papa John mengkhususkan diri dalam menyajikan berbagai jenis pizza yang diolah dengan bahan-bahan berbeda, dan restoran ini bangga mengandalkan banyak bahan segar dalam menyiapkan pizza. Pilihan pizza yang tersedia antara lain pizza sayur, pizza pepperoni, dan pizza ayam, serta menu yang menawarkan berbagai jenis lauk pauk seperti kentang goreng dan bawang bombay.Pizza Papa John dibedakan dari bahan segar berupa daging dan sayuran, serta tomat segar dan keju mozzarella rendah lemak juga digunakan. .