Museum ini dibuka pada tahun 1967 M di Palazzo delle Senzi di Eropa, dengan tujuan menyediakan museum arkeologi dari era pasca-klasik bagi Roma, dan untuk mendorong penelitian dalam periode strategis untuk mempelajari transformasi dunia kuno. Museum Nasional Abad Pertengahan memamerkan barang-barang yang berasal dari abad ke-14 M, sebagian besar berasal dari Roma dan Italia tengah. Di antara koleksi yang dipamerkan di museum ini adalah koleksi “Koptik”, yang terdiri dari prasasti dan kain yang memberikan contoh penting produksi artistik Mesir pada Abad Pertengahan kuno dan awal (abad kelima hingga kesepuluh M).