Museum Arkeologi Cabang Tainan didirikan ketika sejumlah besar artefak dari masa prasejarah ditemukan pada tahun 1995 M. Oleh karena itu, museum ini didirikan untuk menampilkan kembali peradaban yang berusia lebih dari 5.000 tahun. Museum ini terkenal dengan desainnya yang sangat modern, karena mengandalkan gaya arsitektur dekonstruktif untuk menampilkan bagian-bagiannya.Museum ini berisi alun-alun besar dan ruang pameran luas yang berisi barang antik dan gambar bersejarah yang khas.