Museum Ilmu Pengetahuan Alam berisi koleksi sekitar 400 benda, termasuk boneka binatang yang dibuat dengan teknik mumifikasi artistik dan ilmiah, bagian dari hewan yang punah, tengkorak, kerangka, dan bahan biologis yang diawetkan dalam media cair. Museum ini bertanggung jawab atas sekitar 25% fauna Brasilia, dan fokusnya adalah memberikan pendidikan tentang pentingnya melestarikan banyak spesies hewan asli melalui program pendidikannya dan museum keliling yang melewati sekolah-sekolah di sana.