Museum ini bertempat di sebuah bangunan klasik yang dibangun pada tahun 1903 milik Andreas Kalokairinos, yang memberikannya kepada Masyarakat Studi Sejarah Kreta untuk diubah menjadi museum pada tahun 1953. Koleksi permanen museum menyoroti seni dan sejarah Kreta dari abad ke-4. abad M hingga akhir perang Dunia Kedua, koleksinya disusun secara tematis dan kronologis, serta dipadukan dengan materi visual dan multimedia. Ini termasuk keramik, patung, koin, perhiasan, lukisan dinding, ikon, manuskrip, dan banyak lagi. Terdapat juga perpustakaan museum, yang mencakup publikasi langka, arsip ekstensif, dan materi fotografi yang memenuhi kebutuhan peneliti dan masyarakat umum.