Terletak di Menara Fat Margaret di jantung Kota Tua, Museum Maritim Estonia menampilkan sejarah maritim Estonia, termasuk pelabuhan pesawat amfibi tempat kapal-kapal museum ditempatkan. Menara Fat Margaret dibangun dari tahun 1511 hingga 1530 selama pembangunan kembali sistem gerbang abad pertengahan kota. Museum ini menampilkan koleksi instrumen bahari yang tersebar di empat lantai dengan pemandangan Kota Tua, Pelabuhan Tallinn, dan Teluk dari atapnya.