Nama Gua Biru diambil dari warna biru jernih yang mendominasi perairan di sekitarnya dan menambah keindahannya, terutama saat sinar matahari terpantul di area yang terbuka. Ukuran gua-gua di kawasan ini bervariasi, beberapa di antaranya cukup besar untuk dilewati perahu wisata, sementara perahu berhenti di dekat yang lain dan wisatawan melanjutkan perjalanan dengan berenang untuk menjelajahi rahasia gua-gua tersebut.