Masjid Al-Hakim terkenal dengan menaranya yang khas, yaitu menara tertua di Kairo, dan juga merupakan masjid Fatimiyah terbesar kedua di kota tersebut. Masjid ini memiliki cerita menarik tentang khalifah eksentrik bernama Al-Hakim Bi Amr Allah, yang memerintahkan pembangunan masjid pada tahun 990 M, dan kemudian pada usia tiga puluh enam tahun, suatu hari dia keluar dan menghilang tanpa jejak. Masjid ini telah mengalami kerusakan selama bertahun-tahun, pernah digunakan sebagai penjara untuk menahan Tentara Salib, kemudian menjadi gudang untuk Napoleon, digunakan sebagai istal untuk Saladin, dan pada masa pemerintahan Nasser, masjid ini digunakan sebagai sekolah. Baru pada akhir abad ke-20 bangunan ini dipugar dan diubah menjadi masjid.