यह प्राकृतिक इतिहास संग्रहालय स्वयंभूनाथ स्तूप के पास स्थित है, और एक ही समय में सांस्कृतिक, धार्मिक और ऐतिहासिक महत्व के होने के अलावा, यूनेस्को की विश्व विरासत सूची में शामिल मंदिरों का हिस्सा है। इसका उद्देश्य इससे संबंधित बहुमूल्य जानकारी प्रदान करना भी है। नेपाल में स्थानीय प्राकृतिक इतिहास और पर्यावरणीय मुद्दे, क्योंकि इसमें पौधों, भरवां जानवरों, कवक, कीड़े आदि के कुछ नमूने हैं।