प्राकृतिक विज्ञान संग्रहालय में लगभग 400 वस्तुओं का संग्रह है, जिसमें कलात्मक और वैज्ञानिक ममीकरण तकनीक का उपयोग करके बनाए गए भरवां जानवर, विलुप्त जानवरों के हिस्से, खोपड़ी, कंकाल और तरल माध्यम में संरक्षित जैविक सामग्री शामिल हैं। संग्रहालय ब्रासीलिया के लगभग 25% जीव-जंतुओं के लिए जिम्मेदार है, और इसका ध्यान अपने शैक्षिक कार्यक्रम और वहां के स्कूलों से गुजरने वाले एक यात्रा संग्रहालय के माध्यम से कई स्वदेशी पशु प्रजातियों के संरक्षण के महत्व पर शिक्षा प्रदान करने पर है।