प्राकृतिक इतिहास संग्रहालय 11918 ई. में सैन मार्कोस के राष्ट्रीय विश्वविद्यालय में स्थापित किया गया था, और इसे शहर के प्राकृतिक इतिहास संग्रहालयों में से एक माना जाता है। संग्रहालय में नमूनों का एक बड़ा संग्रह शामिल है जिसमें जानवरों, पौधों और खनिजों के नमूने शामिल हैं पेरू, जहां आप जीवाश्मों, डायनासोरों और विभिन्न कंकालों के अलावा सरीसृप, पक्षी और उभयचर देख सकते हैं।