मिशन डोलोरेस बेसिलिका एक अतिरिक्त चर्च है जो पुराने मिशन डोलोरेस चर्च के बगल में बनाया गया था और 1918 में पूरा हुआ था; पर्यटक इसे देख सकते हैं, इसके इतिहास के बारे में जान सकते हैं, इसके डिजाइनों की प्रशंसा कर सकते हैं और मिशन के संस्थापक फादर जुनिपेरो सेरा की मूर्ति देख सकते हैं। गौरतलब है कि यहां खूबसूरत बगीचों के अलावा एक ऐतिहासिक कब्रिस्तान भी है। प्रारंभिक मिशन काल से ही बगीचों में देशी पौधे लगाए गए थे।