कोडोग्नन गुफा को एल निदो में दिलचस्प और प्रभावशाली प्राकृतिक स्थलों में से एक माना जाता है, क्योंकि यह शांत समुद्र तट के पास स्थित है। इसकी विशेषता इसके छोटे कमरे और संकीर्ण खुले स्थान हैं जो अंदर से रोशनी करते हैं। यह वह स्थान है जहां मिट्टी के बर्तनों के टुकड़े और फिलीपीन सांग राजवंश से संबंधित कुछ गहने पाए गए।