मर्सिया एक्वेरियम विश्वविद्यालय खोलने का मुख्य लक्ष्य क्षेत्र के सर्वोच्च शैक्षणिक और अनुसंधान संस्थान (मर्सिया विश्वविद्यालय) को आम जनता के करीब लाना और जीवविज्ञानियों की टीम द्वारा किए गए शोध कार्यों के कुछ पहलुओं को प्रदर्शित करना था। इस एक्वेरियम में आगंतुक दो प्रकार के एक्वेरियम का आनंद ले सकते हैं, एक उष्णकटिबंधीय एक्वेरियम है, जहां लाल सागर, हिंद महासागर, प्रशांत महासागर और कैरेबियन सागर के पारिस्थितिक तंत्र का प्रतिनिधित्व किया जाता है और दूसरा भूमध्यसागरीय एक्वेरियम है।