Le Musée de l'Université de San Carlos, ouvert en 1967, se compose de cinq galeries intérieures et d'une salle ouverte dédiée aux expositions temporaires, et abrite de nombreuses collections anthropologiques et archéologiques, y compris celles illustrant les pratiques de mutilation crânienne du XVIe siècle causées par l'enfance. Outre les anciens cercueils, la collection de céramiques et les animaux momifiés, entre autres.