Contrairement aux autres ponts construits jusqu'à présent au Portugal, le pont Saint-Jean n'est pas un pont en arc, mais un pont droit avec des colonnes verticales et trois travées ; Deux ponts latéraux de 125 mètres et centraux de 250 mètres, le pont se compose d'une seule pièce interconnectée en béton armé et dispose d'une infrastructure solide pour transporter le chemin de fer reliant Vila Nova de Gaia à Porto sur le fleuve Douro.