On pense que le bâtiment actuel de Boyd Chapel a été construit sur les ruines d'une chapelle construite au XIIIe siècle. La partie orientale de Saaremaa - après sa conquête en 1227 - appartenait au régime livonien, qui construisit un château à Boyd comme quartier général pendant la seconde moitié du XIIIe siècle, puis ce château fut détruit par les habitants de Saarema lors de la vague des soulèvements contre les forces d'occupation qui se sont produits en Estonie ; Il y avait une chapelle sur le côté sud du château, et les murs de cette chapelle sont aujourd'hui la partie centrale de l'église de Boyd.