Le musée de la prison de Pawayak a été ouvert le 28 novembre 1965 en tant que filiale du musée de l'histoire du mouvement révolutionnaire polonais. L'inauguration a été suivie par le maréchal polonais Marian Spijalski, car de nombreux anciens prisonniers et leurs familles sont arrivés à l'ouverture et de nombreux habitants de Varsovie. Outre l'ouverture du musée, la première exposition permanente a été présentée à l'intérieur jusqu'en 1991. Outre les intérieurs reconstitués et de nombreux aspects du bâtiment prenant en compte la conservation des documents, des dessins et des témoignages d'anciens prisonniers, c'est un lieu qui reflète la période sombre de la guerre en Pologne.