Le bâtiment moderne du musée Paleopoli abrite une collection distinguée d'artefacts provenant de fouilles et de sites de recherche archéologique dans la région de l'île, où le musée se spécialise dans leur exposition et leur préservation. Les pièces maîtresses de la collection du musée sont des artefacts préhistoriques, des statues de marbre et de bronze, des offrandes funéraires de l'époque historique, des pièces métalliques, de la poterie, des bijoux en or, ainsi que des pièces et des parties d'anciens temples.