Sur le côté sud de la cathédrale se trouve le palais du prieuré, également connu sous le nom de palais municipal, un imposant édifice gothique à l'italienne de la fin du XIIIe et du début du XIVe siècle. Sur le côté faisant face à la place du 4 novembre se trouvent les armoiries de Pérouse, un lion et des chaînes en bronze du XIVe siècle, commémorant la victoire de Pérouse sur Sienne en 1358. Au premier étage du palais, auquel on accède par l'entrée principale magnifiquement sculptée face au Corso Vannucci, se trouve La splendide Sala dei Notari est une salle couverte de fresques de la fin du XIIIe siècle représentant des scènes bibliques et allégoriques.