L'importance de ce musée est due au fait qu'il contient un ancien cimetière qui a été construit dans l'ancienne cathédrale de Caracas en 1673. En 1876, le président vénézuélien Antonio Blanco a publié un décret interdisant les enterrements dans les anciens cimetières, et en conséquence le travail des cimetière arrêté. Plus tard, cette cathédrale a été utilisée comme lieu de séminaires d'enseignement, puis en 1981, par décret présidentiel, ce lieu a été déclaré musée chrétien catholique et monument national et historique.