Le musée archéologique de Madaba est situé à Madaba près de l'église de Jean et est l'une des attractions touristiques de la ville, car il se caractérise par l'abondance de dessins de mosaïques byzantines en son sein, qui remontent à la période entre le Ve et le VIIIe siècle. Les salles abritent des artefacts de plusieurs sites de la région couvrant toutes les grandes périodes historiques, y compris l'âge du fer, romain, byzantin et omeyyade. Ce musée présente une bonne collection de découvertes de Moabit et d'Ammonite. Le prix d'entrée à ce musée dans le billet combiné est de 3 dinars jordaniens et il couvre également le parc archéologique de Madaba et l'église des Apôtres.