Le musée du monastère est divisé avec ses précieuses expositions en sections thématiques couvrant des sujets sur l'histoire, l'art, la culture et la vie d'une manière particulière dans un lieu chargé d'histoire, les horloges de la Forêt-Noire et l'histoire du développement de l'horloge constituent le point central du musée. Chaque année, des expositions temporaires sur la vie et l'art dans la Forêt-Noire sont organisées ici. La collection du musée de l'abbaye de St. Margen est l'une des plus importantes de son genre dans le sud-ouest de l'Allemagne. La présentation dans l'environnement historique crée une expérience holistique unique de paysages, d'art et culturelle.