مدرسه خانوتی از نظر معماری مدرسه یکی از نمونه‌های پیشرو مدارس با ایوان به شمار می‌رود که در فاصله سال‌های 1176 تا 1184 میلادی ساخته شده است. این مدرسه دارای طراحی داخلی متفاوتی است، این بنا که فضایی مستطیل شکل دارد، دارای دو ایوان و یک حیاط با گالری و دو طبقه است که در طول زمان دستخوش تغییرات قابل توجهی شده است، وضعیت اولیه آن بسیار بدتر شده و ساختار حیاط به شدت تخریب شده است. گمشده. تزئینات محراب در ایوان اصلی حکایت از سنگ کاری غنی دوره ارتوقی دارد.