قدمت قبرستان سانتا پائولا به سال 1970 پس از شیوع یک بیماری همه گیر آبله برمی گردد و تا سال 1788 به یک گور دسته جمعی تبدیل شد. در آن گورستان افرادی با امکانات محدود و همچنین برخی از چهره های برجسته و قربانیان اپیدمی وبا در 1850-1852 در مکزیک به خاک سپرده شدند. اما با گذشت زمان، سانتا پائولا تقریباً به طور کامل در اثر زلزله ای که در سال 1858 پس از میلاد رخ داد، ویران شد، اما برخی از خرابه ها و آثار مجسمه های آن تا به امروز وجود دارد.