موزه منطقه ای گواناخواتو یکی از بزرگترین و جالب ترین بناهای تاریخی گواناخواتو است. این ساختمان که به عنوان خزانه سرکوب ساخته شده بود، به عنوان یک قلعه توسط اسپانیایی ها و متحدان وفادار آنها استفاده می شد و نیروهای تحت رهبری میگل هیدالگو در اولین شکست مستعمره نشینانی که قرن ها بر مکزیک حکومت می کردند، تسخیر شد. این ساختمان اکنون به عنوان خانه موزه منطقه‌ای گواناخواتو با نمایش‌های مربوط به نبرد و اعدام هیدالگو عمل می‌کند، و علاوه بر این که شامل مصنوعات بیشتری است که به دوران استعمار بازمی‌گردد، این موزه همچنین شامل مجموعه بزرگی از مواد قبل از کلمبیا است. .