کلیسای Mission of San Diego de Alcala اولین مأموریت فرانسیسکی است که به سن دیگو آمد و اولین بار توسط یک راهب اسپانیایی در سال 1769 پس از میلاد تأسیس شد. در مورد کلیسای فعلی باید گفت که در اوایل قرن نوزدهم ساخته شد. یکی از بناهای مهم تاریخی در سن دیگو به حساب می‌آید و بازدیدکنندگان می‌توانند امروز وارد ساختمان شده و از آن بازدید کنند تا با تاریخچه مکان و مأموریتی که به آن وارد شده است آشنا شوند.