مسجد ایاصوفیه یک نقطه عطف مهم در شهر ایزنیک است، زیرا شاهد دگرگونی های تاریخی بزرگی است که در طول شهر رخ داده است. ساختمان مسجد تحت تأثیر این دگرگونی ها قرار گرفته است، همانطور که از معماری رومی- بیزانسی آن مشخص است. طرحی مبنی بر اینکه در دوران اولیه گسترش دین مسیحیت به عنوان کلیسای رومی ساخته شد و سپس تغییر شکل داد و در طول سالها در دوره عثمانی به مسجد و سپس به موزه مدرن تبدیل شد. ترکیه سکولار، جایی که بازدیدکنندگان می توانند در اطراف آن پرسه بزنند و اختلاط عناصر معماری و مجموعه های مذهبی اسلامی و مسیحی را در حیاط داخلی و خارجی آن ببینند.