يقع متحف بوابة مسقط فوق البوابة التي تفصل ما بين مسقط القديمة ومسقط الحديثة، ويتمتع بإطلالة رائعة تشاهدها من خلال السلالم العريضة المؤدية إلى بوابة المتحف، ويروي تاريخ عُمان الطويل، ويركز بشكل خاص على تاريخ العاصمة مسقط، كما يقدم شرحاً عن نظام الري بالفلج الذي تشتهر به عُمان، بالإضافة إلى العمارة العُمانية المميزة، سواءً في بناء منافذ في المساجد أو القاعات أو الأبواب أو الأقواس الخشبية، ويأخذ هذا المتحف الزائر في رحلة عبر مختلف مراحل تطور ونمو المدينة من ميناء تجاري إلى عاصمة مزدهرة، ويشهد على آثار مسقط وتاريخها.