يمتد موقع تل العمارنة القديم عبر عدة كيلومترات مربعة من الصحراء على حافة نهر النيل، ويتألف من مبانٍ ضخمة ومنشآت على الواجهة البحرية ومناطق صناعية وضواحي سكنية ومقابر على أطراف المدينة، ويمثل تاريخ مدينة قديمة كاملة من المملكة الحديثة (حوالي 1550-1069 قبل الميلاد) محفوظةً تحت غطاء رقيق من رمال الصحراء، وتم هنا اكتشاف 379 لوحًا طينيًا منقوشًا بالخط المسماري فيما يسمى "مكتب التسجيلات" خلال ثمانينيات القرن التاسع عشر، والاكتشاف الأكثر إثارةً فيه هو التمثال النصفي الشهير لنفرتيتي في الموسم الأخير من الحفريات الألمانية (1907-1914).