كنيسة القديس مارجرجس هي كنيسة أرثوذكسية يونانية تقع داخل قلعة بابل في القاهرة القبطية، وهي جزء من دير القديس جاورجيوس البطريركي المقدس التابع لبطريركية الروم الأرثوذكس بالإسكندرية وجميع إفريقيا. ويعود تاريخ الكنيسة إلى القرن العاشر (أو ما قبله)، وقد تم إعادة بناء الهيكل الحالي بعد حريق عام 1904م، وتم الانتهاء في عام 1909م. وتتميز الكنيسة اليوم بنمطٍ بناء قوطي يضم الساحات الفسيحة والأعمدة والزوايا، بالإضافة إلى عددٍ من الأضرحة التي تعود لشخصيات تاريخية دينية مهمة.