يقدم معرض المتحف الأثري عدداً من القطع والآثار المتميزة, مما يضعه ضمن أولى الوجهات التي يجب زيارتها عند السفر إلى تطوان, ومن ضمن ما يعرضه المتحف في مجموعته الدائمة قطعة الفسيفساء الرومانية والتي تدعى "النعم الثلاثة", هذا بالإضافة إلى عدد من الآثار الخاصة بشمال المغرب, والتي تشمل أدوات عائدة لما قبل التاريخ وعملات معدنية وأعمال برونزية وأعمال فخارية, وهو يحوي كذلك مكتبة مذهلة، مع أكثر من ستين ألف مجلد يخلد الأدب الخاص بشمال إفريقيا.