يعرض متحف مالطا البحري التاريخ البحري لمالطا. كما أنه يوضح الطبيعة العالمية للإبحار البحري وأثره على مجتمع مالطا. إذ يضم المتحف العديد من المعارض التي تسلط الضوء على حقب مختلفة من تاريخ مالطا و التي تعرض بعض القطع الأثرية الفريدة. بما في ذلك أكبر مرساة رومانية في العالم ،و أكبر نموذج سفينة تابعة لوسام القديس جون، و أكبر مجموعة من المدافع في الجزيرة، ومجموعة من القوارب الاخرى.