يقع متحف المهدية في مباني البلدية القديمة التي تم تجديدها بالكامل لاستيعاب مجموعاته، ويعكس التاريخ العام لتونس والذي ساهمت فيه مدينة المهدية بشكل كبير، وقد افتتح مجموعاته في عام 1997، وهي تقدم العديد من القطع الأثرية، بما في ذلك السيراميك الذي ينتمي إلى الفترتين البونية والرومانية، ومجموعة جميلة من الفسيفساء، وكنز بيزنطي مع 268 قطعة نقدية ذهبية، بالإضافة إلى مقتنيات مختلفة من العصر الإسلامي. ويقدم المتحف للزوار قطع تعود إلى العصور القديمة ليبيكو-بونيك والرومانية الإفريقية، بينما هناك جزء من الأرضية مخصص لإرث العصور البيزنطية والإسلامية، ويتم تمثيل الحضارة اليونانية عبر عمودين من الرخام متآكلان جزئياً، كما يعرض المتحف مجموعة كبيرة من الحرف من المدينة والمناطق المحيطة بها والتي يعود بعضها إلى إلى الأسرة الفاطمية التي أسست المدينة في القرن العاشر، كالأعمال الخشبية المنحوتة والمطلية، والفسيفساء، والجص المزخرف، والسيراميك، والأواني الفخارية وغيرها، وقد تم أيضاً تخصيص غرفتين؛ إحداهما للنسيج والأخرى للأزياء التقليدية الفخمة في منطقة المهدية، وتعرض غرفة "الكنوز والمجوهرات" عملات ذهبية وزخارف تقليدية ترتديها نساء المنطقة.